پژوهشکده هماتولوژی، انکولوژی و پیوند سلولهای بنیادی با هدف ارتقاء سطح علمی و درمانی، همکاریهای گستردهای را در سطح ملی و بینالمللی برقرار کرده است. این پژوهشکده به عنوان نخستین دارنده بانک دادههای HLA در منطقه شرق مدیترانه، موسوم به بانک اهداکنندگان سلول بنیادی ایران (ISCDP)، که از سال ۲۰۱۰ عضو شبکه جهانی بانکهای مغز استخوان است، نقشی کلیدی در توسعه تعاملات علمی و درمانی ایفا میکند.
همکاریهای بینالمللی پژوهشکده شامل مشارکت فعال در پروژههای تحقیقاتی مشترک با مراکز تحقیقاتی معتبر جهانی، سازمان بهداشت جهانی و دانشگاههای برجسته است. تا کنون، پژوهشکده در بیش از ۱۸ پروژه بزرگ بینالمللی مشارکت داشته و بیش از ۲۰۰ مقاله علمی معتبر در سطح جهانی منتشر کرده است.
در سطح ملی نیز، این مرکز با راهاندازی شبکههای پژوهشی و اجرای پروژههای مشترک با سایر مراکز علمی و پزشکی کشور، بستری قوی برای تبادل دانش و توسعه تحقیقات در زمینه انکولوژی، هماتولوژی و سل تراپی فراهم کرده است. همچنین، شبکهای ملی از مراکز تحقیقات انکولوژی و هماتولوژی ایجاد شده که همکاریهای مستمر و اثربخشی در جهت پیشرفت علمی و ارتقای کیفیت خدمات درمانی در سطح کشور دارد.
پژوهشکده همواره در تلاش است تا با توسعه این همکاریها، جایگاه خود را به عنوان یکی از مراکز پیشرو در حوزههای تحقیقاتی و درمانی سلولهای بنیادی و سرطان در منطقه و جهان تثبیت نماید.